Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clec11aO88200 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Clec11aO88200 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clec11aO88200 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clec11aO88200 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clec11aO88200 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clec11aO88200 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clec11aO88200 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clec11aO88200 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clec11aO88200 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clec11aO88200 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clec11aO88200 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms