Protein–RNA interactions for Protein: O70493

Snx12, Sorting nexin-12, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx12O70493 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx12O70493 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx12O70493 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx12O70493 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx12O70493 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx12O70493 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx12O70493 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx12O70493 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx12O70493 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx12O70493 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx12O70493 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx12O70493 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx12O70493 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx12O70493 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx12O70493 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms