Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb5O70309 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb5O70309 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb5O70309 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb5O70309 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb5O70309 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb5O70309 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb5O70309 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb5O70309 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb5O70309 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb5O70309 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb5O70309 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb5O70309 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb5O70309 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb5O70309 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb5O70309 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb5O70309 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Itgb5O70309 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Itgb5O70309 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Itgb5O70309 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb5O70309 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms