Protein–RNA interactions for Protein: O54990

Prom1, Prominin-1, mousemouse

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom1O54990 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prom1O54990 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prom1O54990 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prom1O54990 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Prom1O54990 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prom1O54990 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prom1O54990 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Prom1O54990 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prom1O54990 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prom1O54990 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prom1O54990 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prom1O54990 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Prom1O54990 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prom1O54990 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prom1O54990 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prom1O54990 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prom1O54990 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Prom1O54990 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prom1O54990 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prom1O54990 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prom1O54990 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prom1O54990 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prom1O54990 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prom1O54990 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prom1O54990 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.7 ms