Protein–RNA interactions for Protein: O54943

Per2, Period circadian protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per2O54943 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Per2O54943 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Per2O54943 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Per2O54943 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Per2O54943 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Per2O54943 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Per2O54943 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Per2O54943 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Per2O54943 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Per2O54943 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Per2O54943 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Per2O54943 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Per2O54943 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Per2O54943 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Per2O54943 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Per2O54943 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Per2O54943 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Per2O54943 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Per2O54943 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Per2O54943 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Per2O54943 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Per2O54943 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Per2O54943 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Per2O54943 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Per2O54943 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Per2O54943 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Per2O54943 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Per2O54943 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Per2O54943 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Per2O54943 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Per2O54943 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Per2O54943 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Per2O54943 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Per2O54943 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Per2O54943 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Per2O54943 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Per2O54943 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Per2O54943 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Per2O54943 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Per2O54943 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Per2O54943 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Per2O54943 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Per2O54943 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Per2O54943 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Per2O54943 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Per2O54943 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Per2O54943 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Per2O54943 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Per2O54943 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Per2O54943 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Per2O54943 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Per2O54943 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Per2O54943 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Per2O54943 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Per2O54943 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Per2O54943 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Per2O54943 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Per2O54943 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Per2O54943 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Per2O54943 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Per2O54943 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Per2O54943 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Per2O54943 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Per2O54943 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Per2O54943 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Per2O54943 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Per2O54943 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Per2O54943 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Per2O54943 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Per2O54943 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Per2O54943 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Per2O54943 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Per2O54943 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Per2O54943 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Per2O54943 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Per2O54943 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Per2O54943 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Per2O54943 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Per2O54943 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Per2O54943 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Per2O54943 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Per2O54943 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Per2O54943 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Per2O54943 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Per2O54943 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Per2O54943 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Per2O54943 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Per2O54943 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Per2O54943 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Per2O54943 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Per2O54943 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Per2O54943 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Per2O54943 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Per2O54943 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Per2O54943 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Per2O54943 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Per2O54943 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Per2O54943 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Per2O54943 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Per2O54943 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms