Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

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Length 452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Timm44O35857 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Timm44O35857 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Timm44O35857 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Timm44O35857 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Timm44O35857 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Timm44O35857 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Timm44O35857 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Timm44O35857 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Timm44O35857 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Timm44O35857 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Timm44O35857 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Timm44O35857 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Timm44O35857 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Timm44O35857 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Timm44O35857 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Timm44O35857 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Timm44O35857 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Timm44O35857 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Timm44O35857 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Timm44O35857 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Timm44O35857 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Timm44O35857 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Timm44O35857 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Timm44O35857 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Timm44O35857 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Timm44O35857 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Timm44O35857 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Timm44O35857 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Timm44O35857 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Timm44O35857 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Timm44O35857 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Timm44O35857 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Timm44O35857 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Timm44O35857 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Timm44O35857 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms