Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Stx1aO35526 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx1aO35526 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms