Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc27a2O35488 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a2O35488 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc27a2O35488 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms