Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xbp1O35426 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Xbp1O35426 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Xbp1O35426 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms