Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppef2O35385 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppef2O35385 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ppef2O35385 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppef2O35385 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms