Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kpna3O35344 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Kpna3O35344 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kpna3O35344 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kpna3O35344 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kpna3O35344 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kpna3O35344 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kpna3O35344 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kpna3O35344 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Kpna3O35344 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kpna3O35344 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kpna3O35344 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kpna3O35344 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kpna3O35344 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kpna3O35344 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kpna3O35344 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kpna3O35344 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kpna3O35344 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kpna3O35344 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kpna3O35344 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna3O35344 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna3O35344 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna3O35344 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna3O35344 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna3O35344 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna3O35344 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna3O35344 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms