Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfrsf11aO35305 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfrsf11aO35305 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfrsf11aO35305 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfrsf11aO35305 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfrsf11aO35305 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfrsf11aO35305 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfrsf11aO35305 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfrsf11aO35305 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfrsf11aO35305 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfrsf11aO35305 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfrsf11aO35305 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfrsf11aO35305 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfrsf11aO35305 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfrsf11aO35305 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfrsf11aO35305 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfrsf11aO35305 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfrsf11aO35305 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfrsf11aO35305 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfrsf11aO35305 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnfrsf11aO35305 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms