Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bhlhe40O35185 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bhlhe40O35185 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bhlhe40O35185 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms