Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snap23O09044 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snap23O09044 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snap23O09044 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Snap23O09044 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Snap23O09044 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snap23O09044 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snap23O09044 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Snap23O09044 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snap23O09044 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snap23O09044 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snap23O09044 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snap23O09044 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snap23O09044 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snap23O09044 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snap23O09044 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snap23O09044 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snap23O09044 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snap23O09044 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snap23O09044 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snap23O09044 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snap23O09044 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snap23O09044 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snap23O09044 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snap23O09044 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snap23O09044 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snap23O09044 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Snap23O09044 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Snap23O09044 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Snap23O09044 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Snap23O09044 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Snap23O09044 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snap23O09044 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snap23O09044 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snap23O09044 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snap23O09044 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Snap23O09044 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snap23O09044 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Snap23O09044 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snap23O09044 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snap23O09044 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snap23O09044 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snap23O09044 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snap23O09044 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snap23O09044 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snap23O09044 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Snap23O09044 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Snap23O09044 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Snap23O09044 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Snap23O09044 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snap23O09044 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snap23O09044 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snap23O09044 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snap23O09044 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snap23O09044 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms