Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nfil3O08750 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfil3O08750 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfil3O08750 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfil3O08750 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfil3O08750 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfil3O08750 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfil3O08750 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfil3O08750 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfil3O08750 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfil3O08750 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nfil3O08750 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nfil3O08750 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nfil3O08750 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nfil3O08750 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nfil3O08750 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nfil3O08750 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nfil3O08750 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nfil3O08750 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nfil3O08750 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nfil3O08750 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nfil3O08750 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nfil3O08750 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nfil3O08750 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nfil3O08750 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nfil3O08750 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfil3O08750 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfil3O08750 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfil3O08750 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfil3O08750 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nfil3O08750 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms