Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MttpO08601 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MttpO08601 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MttpO08601 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MttpO08601 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MttpO08601 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MttpO08601 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MttpO08601 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MttpO08601 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MttpO08601 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MttpO08601 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MttpO08601 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MttpO08601 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MttpO08601 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MttpO08601 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MttpO08601 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MttpO08601 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MttpO08601 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MttpO08601 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MttpO08601 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MttpO08601 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MttpO08601 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MttpO08601 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MttpO08601 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MttpO08601 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MttpO08601 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MttpO08601 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MttpO08601 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MttpO08601 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MttpO08601 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MttpO08601 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MttpO08601 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MttpO08601 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MttpO08601 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MttpO08601 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MttpO08601 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MttpO08601 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MttpO08601 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MttpO08601 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MttpO08601 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MttpO08601 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MttpO08601 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MttpO08601 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MttpO08601 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MttpO08601 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MttpO08601 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MttpO08601 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MttpO08601 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MttpO08601 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MttpO08601 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MttpO08601 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MttpO08601 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MttpO08601 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MttpO08601 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MttpO08601 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MttpO08601 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MttpO08601 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MttpO08601 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MttpO08601 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MttpO08601 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MttpO08601 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MttpO08601 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MttpO08601 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MttpO08601 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MttpO08601 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MttpO08601 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MttpO08601 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MttpO08601 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MttpO08601 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MttpO08601 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MttpO08601 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MttpO08601 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MttpO08601 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MttpO08601 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MttpO08601 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MttpO08601 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MttpO08601 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MttpO08601 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MttpO08601 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MttpO08601 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MttpO08601 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MttpO08601 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MttpO08601 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MttpO08601 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MttpO08601 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MttpO08601 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MttpO08601 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MttpO08601 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MttpO08601 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MttpO08601 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MttpO08601 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MttpO08601 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MttpO08601 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MttpO08601 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MttpO08601 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MttpO08601 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MttpO08601 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MttpO08601 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MttpO08601 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MttpO08601 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms