Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AlyrefO08583 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AlyrefO08583 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlyrefO08583 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlyrefO08583 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AlyrefO08583 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlyrefO08583 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlyrefO08583 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlyrefO08583 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlyrefO08583 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlyrefO08583 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlyrefO08583 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AlyrefO08583 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlyrefO08583 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlyrefO08583 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlyrefO08583 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AlyrefO08583 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AlyrefO08583 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AlyrefO08583 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AlyrefO08583 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AlyrefO08583 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AlyrefO08583 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
AlyrefO08583 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AlyrefO08583 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AlyrefO08583 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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