Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MsmbO08540 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MsmbO08540 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsmbO08540 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsmbO08540 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsmbO08540 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsmbO08540 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MsmbO08540 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MsmbO08540 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MsmbO08540 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MsmbO08540 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MsmbO08540 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MsmbO08540 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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