Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ascl4M0QW46 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ascl4M0QW46 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms