Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2al1oL7MU04 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2al1oL7MU04 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2al1oL7MU04 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2al1oL7MU04 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2al1oL7MU04 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2al1oL7MU04 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2al1oL7MU04 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2al1oL7MU04 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2al1oL7MU04 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2al1oL7MU04 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2al1oL7MU04 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2al1oL7MU04 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2al1oL7MU04 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2al1oL7MU04 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2al1oL7MU04 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2al1oL7MU04 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2al1oL7MU04 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2al1oL7MU04 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2al1oL7MU04 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2al1oL7MU04 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2al1oL7MU04 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2al1oL7MU04 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2al1oL7MU04 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2al1oL7MU04 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2al1oL7MU04 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2al1oL7MU04 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2al1oL7MU04 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2al1oL7MU04 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2al1oL7MU04 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms