Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY1

Gm9242, Predicted pseudogene 9242, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9242J3QNY1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm9242J3QNY1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm9242J3QNY1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms