Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam240aJ3QNP9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Fam240aJ3QNP9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Fam240aJ3QNP9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Fam240aJ3QNP9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Fam240aJ3QNP9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Fam240aJ3QNP9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Fam240aJ3QNP9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Fam240aJ3QNP9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam240aJ3QNP9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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