Protein–RNA interactions for Protein: J3QN52

Gm16427, Predicted gene 16427, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16427J3QN52 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm16427J3QN52 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm16427J3QN52 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms