Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21972J3QN38 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms