Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20918J3QN17 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.9 ms