Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm3415J3QMS8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3415J3QMS8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3415J3QMS8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
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