Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp408H7BX78 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Zfp408H7BX78 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms