Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r34G3XA52 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r34G3XA52 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r34G3XA52 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r34G3XA52 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r34G3XA52 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r34G3XA52 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r34G3XA52 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r34G3XA52 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r34G3XA52 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms