Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nccrp1G3X9C2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nccrp1G3X9C2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nccrp1G3X9C2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.2 ms