Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna9G3X8Z7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna9G3X8Z7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna9G3X8Z7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna9G3X8Z7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna9G3X8Z7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna9G3X8Z7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna9G3X8Z7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna9G3X8Z7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna9G3X8Z7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna9G3X8Z7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna9G3X8Z7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna9G3X8Z7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna9G3X8Z7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna9G3X8Z7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms