Protein–RNA interactions for Protein: F8VQH7

Dbx2, Developing brain homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx2F8VQH7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dbx2F8VQH7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dbx2F8VQH7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dbx2F8VQH7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dbx2F8VQH7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dbx2F8VQH7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dbx2F8VQH7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dbx2F8VQH7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dbx2F8VQH7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dbx2F8VQH7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dbx2F8VQH7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dbx2F8VQH7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms