Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Srp72F8VQC1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Srp72F8VQC1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srp72F8VQC1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms