Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Speer4aF8VPX6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4aF8VPX6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Speer4aF8VPX6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Speer4aF8VPX6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms