Protein–RNA interactions for Protein: F6ZNL5

Pcdh11x, Protocadherin 11 X-linked, mousemouse

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdh11xF6ZNL5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pcdh11xF6ZNL5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdh11xF6ZNL5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdh11xF6ZNL5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdh11xF6ZNL5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdh11xF6ZNL5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdh11xF6ZNL5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdh11xF6ZNL5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms