Protein–RNA interactions for Protein: F6YHC1

Gm6482, Predicted gene 6482 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6482F6YHC1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6482F6YHC1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6482F6YHC1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6482F6YHC1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6482F6YHC1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6482F6YHC1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6482F6YHC1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm6482F6YHC1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm6482F6YHC1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm6482F6YHC1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm6482F6YHC1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm6482F6YHC1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm6482F6YHC1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm6482F6YHC1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm6482F6YHC1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6482F6YHC1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6482F6YHC1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6482F6YHC1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6482F6YHC1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6482F6YHC1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6482F6YHC1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6482F6YHC1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6482F6YHC1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6482F6YHC1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6482F6YHC1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6482F6YHC1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6482F6YHC1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6482F6YHC1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm6482F6YHC1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm6482F6YHC1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm6482F6YHC1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm6482F6YHC1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm6482F6YHC1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm6482F6YHC1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm6482F6YHC1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm6482F6YHC1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm6482F6YHC1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm6482F6YHC1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm6482F6YHC1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm6482F6YHC1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm6482F6YHC1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm6482F6YHC1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm6482F6YHC1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm6482F6YHC1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm6482F6YHC1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm6482F6YHC1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm6482F6YHC1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm6482F6YHC1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm6482F6YHC1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm6482F6YHC1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms