Protein–RNA interactions for Protein: F6R5P4

Ccl17, C-C motif chemokine, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl17F6R5P4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl17F6R5P4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl17F6R5P4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms