Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm29094F6Q785 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm29094F6Q785 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm29094F6Q785 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms