Protein–RNA interactions for Protein: F2Z472

Svs3a, Seminal vesicle secretory protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svs3aF2Z472 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Svs3aF2Z472 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Svs3aF2Z472 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Svs3aF2Z472 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Svs3aF2Z472 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Svs3aF2Z472 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Svs3aF2Z472 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Svs3aF2Z472 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Svs3aF2Z472 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Svs3aF2Z472 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Svs3aF2Z472 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Svs3aF2Z472 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Svs3aF2Z472 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Svs3aF2Z472 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Svs3aF2Z472 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Svs3aF2Z472 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Svs3aF2Z472 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Svs3aF2Z472 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Svs3aF2Z472 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Svs3aF2Z472 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Svs3aF2Z472 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Svs3aF2Z472 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms