Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P5

Gm3127, Predicted gene 3127, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3127E9Q9P5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3127E9Q9P5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3127E9Q9P5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3127E9Q9P5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3127E9Q9P5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3127E9Q9P5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3127E9Q9P5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3127E9Q9P5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm3127E9Q9P5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm3127E9Q9P5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3127E9Q9P5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm3127E9Q9P5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3127E9Q9P5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3127E9Q9P5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3127E9Q9P5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3127E9Q9P5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3127E9Q9P5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3127E9Q9P5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3127E9Q9P5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm3127E9Q9P5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3127E9Q9P5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3127E9Q9P5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3127E9Q9P5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3127E9Q9P5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3127E9Q9P5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3127E9Q9P5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3127E9Q9P5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3127E9Q9P5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3127E9Q9P5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3127E9Q9P5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3127E9Q9P5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm3127E9Q9P5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms