Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga10E9Q6R1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga10E9Q6R1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms