Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5G2

Pcdhb9, Protocadherin beta 9, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb9E9Q5G2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcdhb9E9Q5G2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdhb9E9Q5G2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdhb9E9Q5G2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdhb9E9Q5G2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdhb9E9Q5G2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdhb9E9Q5G2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdhb9E9Q5G2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdhb9E9Q5G2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdhb9E9Q5G2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdhb9E9Q5G2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdhb9E9Q5G2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdhb9E9Q5G2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdhb9E9Q5G2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdhb9E9Q5G2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdhb9E9Q5G2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms