Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ApobE9Q414 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ApobE9Q414 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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