Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L2

Pi4ka, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4kaE9Q3L2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pi4kaE9Q3L2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pi4kaE9Q3L2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pi4kaE9Q3L2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pi4kaE9Q3L2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pi4kaE9Q3L2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pi4kaE9Q3L2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pi4kaE9Q3L2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pi4kaE9Q3L2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pi4kaE9Q3L2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pi4kaE9Q3L2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pi4kaE9Q3L2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pi4kaE9Q3L2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pi4kaE9Q3L2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pi4kaE9Q3L2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pi4kaE9Q3L2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pi4kaE9Q3L2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pi4kaE9Q3L2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pi4kaE9Q3L2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pi4kaE9Q3L2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pi4kaE9Q3L2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pi4kaE9Q3L2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pi4kaE9Q3L2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pi4kaE9Q3L2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pi4kaE9Q3L2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pi4kaE9Q3L2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pi4kaE9Q3L2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms