Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Tarbp1E9Q368 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Tarbp1E9Q368 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Tarbp1E9Q368 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
Tarbp1E9Q368 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Tarbp1E9Q368 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
Tarbp1E9Q368 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Tarbp1E9Q368 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Tarbp1E9Q368 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Tarbp1E9Q368 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Tarbp1E9Q368 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tarbp1E9Q368 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tarbp1E9Q368 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tarbp1E9Q368 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tarbp1E9Q368 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tarbp1E9Q368 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tarbp1E9Q368 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Tarbp1E9Q368 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Tarbp1E9Q368 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Tarbp1E9Q368 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Tarbp1E9Q368 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tarbp1E9Q368 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tarbp1E9Q368 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tarbp1E9Q368 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Tarbp1E9Q368 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tarbp1E9Q368 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tarbp1E9Q368 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tarbp1E9Q368 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tarbp1E9Q368 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tarbp1E9Q368 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Tarbp1E9Q368 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tarbp1E9Q368 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tarbp1E9Q368 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Tarbp1E9Q368 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tarbp1E9Q368 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tarbp1E9Q368 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tarbp1E9Q368 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tarbp1E9Q368 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tarbp1E9Q368 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tarbp1E9Q368 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Tarbp1E9Q368 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Tarbp1E9Q368 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Tarbp1E9Q368 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Tarbp1E9Q368 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Tarbp1E9Q368 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Tarbp1E9Q368 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tarbp1E9Q368 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tarbp1E9Q368 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tarbp1E9Q368 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tarbp1E9Q368 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tarbp1E9Q368 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tarbp1E9Q368 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tarbp1E9Q368 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tarbp1E9Q368 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tarbp1E9Q368 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tarbp1E9Q368 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tarbp1E9Q368 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tarbp1E9Q368 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Tarbp1E9Q368 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Tarbp1E9Q368 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Tarbp1E9Q368 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tarbp1E9Q368 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tarbp1E9Q368 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tarbp1E9Q368 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tarbp1E9Q368 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tarbp1E9Q368 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Tarbp1E9Q368 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tarbp1E9Q368 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tarbp1E9Q368 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tarbp1E9Q368 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tarbp1E9Q368 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tarbp1E9Q368 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tarbp1E9Q368 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tarbp1E9Q368 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tarbp1E9Q368 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tarbp1E9Q368 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tarbp1E9Q368 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tarbp1E9Q368 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms