Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Abcc4E9Q236 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Abcc4E9Q236 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms