Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm3095E9Q058 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3095E9Q058 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3095E9Q058 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms