Protein–RNA interactions for Protein: E9Q048

Ermard, ER membrane-associated RNA degradation, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErmardE9Q048 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ErmardE9Q048 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ErmardE9Q048 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ErmardE9Q048 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ErmardE9Q048 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ErmardE9Q048 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ErmardE9Q048 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ErmardE9Q048 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ErmardE9Q048 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ErmardE9Q048 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ErmardE9Q048 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ErmardE9Q048 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ErmardE9Q048 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ErmardE9Q048 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ErmardE9Q048 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ErmardE9Q048 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ErmardE9Q048 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ErmardE9Q048 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ErmardE9Q048 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ErmardE9Q048 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ErmardE9Q048 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ErmardE9Q048 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ErmardE9Q048 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ErmardE9Q048 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ErmardE9Q048 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms