Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Brd1E9PZ26 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Brd1E9PZ26 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Brd1E9PZ26 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms