Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim30dE9PWL0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim30dE9PWL0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim30dE9PWL0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim30dE9PWL0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim30dE9PWL0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim30dE9PWL0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim30dE9PWL0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim30dE9PWL0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim30dE9PWL0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim30dE9PWL0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim30dE9PWL0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim30dE9PWL0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim30dE9PWL0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim30dE9PWL0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trim30dE9PWL0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trim30dE9PWL0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trim30dE9PWL0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trim30dE9PWL0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim30dE9PWL0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim30dE9PWL0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim30dE9PWL0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms