Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3002E9PW72 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3002E9PW72 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm3002E9PW72 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm3002E9PW72 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm3002E9PW72 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms